游戏发行商 Eidos 以“世界最小的英雄”来介绍《迷你忍者》，玩家在游戏中将加入一场从未经历过的忍者冒险，与世界最小的英雄 Hiro 一起面对最大的危机，他将接受一连串刺激的任务考验，以便能够平息世间的混乱，唤回世界的和平。

玩家在游戏中将通过一连串忍者的训练，磨练个人的技能，来对抗邪恶武士的魔法大军。当玩家在危险世界中冒险，终于要揭开邪恶武士军的真面目、展开最终决战时，学会驾驭九印魔法的力量，并与其他忍者伙伴合作使出特殊技能，将可助玩家迈向成功之路。