《忍者龙剑传 3》为 Team NINJA 经历 KOEI 收购，团队重整后第一款真正原创开发的作品，此时 Team NINJA 的领导人为早史仕洋介，同时也是《忍者龙剑传 3》的制作人。

在故事开端，恐怖份子占领伦敦白宫，并指名交出龙隼。龙隼在日本政府的委托下来到伦敦准备揪出幕后黑手，经过一连串的冲突，龙隼于白宫中遇到自称“假面导师”的男子。龙隼虽然在一番激烈的对决后击败假面导师，但假面导师也在龙隼手臂施下一道杀人者的诅咒“人杀しの业”，此诅咒会不断侵蚀宿主，最终使宿主死亡。另一方面，一股阴谋也在背地里悄悄进行着，龙隼必须忍受着诅咒的折磨，贯彻龙族正义拯救世界。

本作颠覆以往的游……显示全部戏系统，魂系统取消、补给品取消、无升级要素。初版上市仅有一种武器“日本刀”(Katana)，随着剧情获得新招式。新的“断骨”系统为本作强调的重点，游戏中镜头会拉近日本刀砍进敌人身躯的画面，制作团队于开发日志影片中，表示此设计是为了让玩家感受“刀身砍过骨头的真实感”。本作仅有一把武器受到玩家猛烈的批评，官方于日后释出“硬壳猛禽爪”与“闇月镰刀”的免费 DLC 供玩家下载。

线上模式部分，本作拥有“忍者试炼”，玩家们可与朋友双人合作挑战官方设计的关卡。同时，本作新增了全新的模式“忍众战场”，玩家扮演一位无名忍者，在一个 4 VS 4 的地图中进行厮杀。

本作不论 PS3 或 Xbox360 版本皆存在严重的画面延迟问题，玩家戏称“太空漫步”，此问题已于 PS3 与 Xbox360 版本的《忍者龙剑传 3：利刃边缘》中获得改善。