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1999：《穿越时空》

作为超级名作《时空之轮》的续作，《穿越时空》虽然集结了前作大多人马，平台由 SFC 改为 PS 从而达到画面的大幅提升，并且北美发行时受到绝对好评，但它却因为风格与前作差别太大而不在日本国内受到欢迎。

直观地看，鸟山明的人设被替换为结城信辉，由热血少年转为浓烈渲染；故事也由加入时间穿梭要素的王道风格转为颇具深度的神秘诡异，战斗系统更是做了许多纷繁复杂的变化。这种改变让前作粉丝拿到手之后叫苦不迭，而它也理所当然地影响到了销量，甚至原本计划之中的系列第三部作品到如今也悄无音讯。如果你在网络查阅相关资料，也会发现，《穿越时空》得到的关注与前作相比少得可怜。

但这实在是一个市场造成的巨大遗憾，可能也是日后我们经常吐槽日厂不思进取的原因之一：虽然《穿越时空》做出了巨大改变，但它并没有脱离时空扭转的概念，只是把笔触更多放在平行世界之中人物彼此之间造成的影响与改变，哪怕从严格意义来说，放在时空系列之中也并无不妥。更重要的是，《穿越时空》本身是一款非常优秀的作品，我们也能看到 Square 在这款作品之中花费的心力。有人说，它只是不算一款成功的续作，一语道破，令人惋惜。

游戏讲述了 セルジュ 穿越两个平行世界探索自己曾经年少去世的秘密，如前作一样，故事包含许多用心的细节，在后期揭开谜底时会有恍然之感。游戏也包含了与前作互动的捏他，但多数比较隐晦。

在系统上，游戏采取了一些比较独特的设定。首先，可以收集的同伴包括 45 名；其次，取消了道具的设定，而以可装备魔法承担道具功能；攻击分为轻重，并有耐力设定等；成长系统也与一个被称为星星的要素有关。总之相当复杂。这种复杂虽然一定程度带来了策略思考，但也成为阻碍，而且平衡有一些问题，比如许多同伴并不会被派上用场。

2003：《星球大战：旧共和国武士》

《星球大战：旧共和国武士（Star Wars: Knights of the Old Republic）》（通常缩写为 KOTOR）是一款以星球大战宇宙为背景的角色扮演游戏。该游戏由 BioWare 开发，LucasArts 发行，先行于 Xbox 发布，2003 年 11 月 19 日登陆 PC 平台。

《星球大战：旧共和国武士》的故事发生在银河帝国成立前近 4000 年，黑暗的西斯王 Darth Malak 发动了西斯舰队来对抗共和国。玩家角色作为一名绝地武士，必须冒险前往银河系中的不同星球打败 Malak。玩家在游戏开始时从三种角色类别中选择并定制自己的角色，并与敌人进行回合制战斗。通过与其他角色的互动和做出剧情选择，玩家可以获得光明面和黑暗面点数，游戏中的系统将决定玩家的角色是与原力的光明面还是黑暗面保持一致。

游戏由 Casey Hudson 监制（他后来还监制了《质量效应》），James Ohlen 设计，Drew Karpyshyn 编剧。他们决定将游戏设定在《星球大战：第一集 - 幻影威胁》之前 4000 年，这是一个以前几乎没有涉及的时期，所以这给了他们更大的创作自由度。他们的目标是创造出与电影中类似的内容，但又足够不同，这是开发中的一个明确的指导思想。

LucasArts 和 BioWare 决定基于 PC 和 Xbox 开发。之所以选择 Xbox 而不是其他主机平台，是因为 BioWare 有开发 PC 游戏的背景，而且相比之下更熟悉 Xbox 平台，而不像在 PS2 或 GameCube 上那样需要花费很多精力。当然，也因为 Xbox 当时比较成功，而且他们有机会发布 Xbox 上的第一款 RPG 游戏之一。

开发这款游戏使用了奥德赛引擎（Odyssey Engine），它基于极光引擎（Aurora Engine，之前由 BioWare 开发，用于《无冬之夜》），但为了这款游戏完全进行了重写，它在当时看来是高度细致的：风中的草浪，尘埃吹过塔图因，当玩家在海底行走时，一阵阵沙尘扬起，看起来棒极了。

角色动画的编排是使用 3DS Max 完成的[12] Hudson 指出，游戏机和 PC 之间的差异意味着图形将不得不进行修改。"你通常是在房间对面的电视上玩控制台游戏，而 PC 游戏则是在只有几英寸远的显示器上玩。"[11]控制台游戏在特写动作和整体渲染质量上下功夫；PC 游戏则强调用高分辨率和超清晰的纹理可以做什么。哈德森还指出，游戏控制器和鼠标与键盘设置的不同影响了一些设计决策[11]，PC 版多了一个玩家可以访问的地点，以及更多的 NPC、物品和武器；这些新增内容后来在 Xbox 版上通过 Xbox Live 提供。PC 版支持更高的显示分辨率（最高 1600x1200），并拥有更高分辨率的纹理[13] 。

《星球大战：旧共和国武士》游戏于 2000 年正式公布，但在 2003 年 7 月发布前曾多次推迟。不过一经发布就获得了广泛的好评，评论家们对游戏的角色、故事和音乐音效表现都很欣赏。它被提名了许多奖项，被认为是有史以来最好的电子游戏之一。

在 BioWare 的建议下，黑曜石娱乐公司开发的续作《星球大战：旧共和国骑士团 II - 西斯领主》于 2004 年发布。2011 年，BioWare 开发的大型多人在线角色扮演游戏《星球大战：旧共和国》发布，继续了该系列的故事。